Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PvalbP32848 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PvalbP32848 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PvalbP32848 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PvalbP32848 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PvalbP32848 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PvalbP32848 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PvalbP32848 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PvalbP32848 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PvalbP32848 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PvalbP32848 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PvalbP32848 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PvalbP32848 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PvalbP32848 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PvalbP32848 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PvalbP32848 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms