Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa2P31245 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa2P31245 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa2P31245 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa2P31245 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa2P31245 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa2P31245 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa2P31245 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxa2P31245 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa2P31245 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa2P31245 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxa2P31245 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxa2P31245 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa2P31245 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa2P31245 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa2P31245 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxa2P31245 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxa2P31245 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa2P31245 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa2P31245 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa2P31245 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa2P31245 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa2P31245 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa2P31245 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa2P31245 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa2P31245 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa2P31245 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa2P31245 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa2P31245 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa2P31245 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa2P31245 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa2P31245 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa2P31245 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa2P31245 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa2P31245 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa2P31245 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa2P31245 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa2P31245 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa2P31245 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa2P31245 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa2P31245 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa2P31245 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa2P31245 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa2P31245 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa2P31245 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa2P31245 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa2P31245 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa2P31245 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa2P31245 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa2P31245 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa2P31245 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa2P31245 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa2P31245 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa2P31245 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.9 ms