Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Col2a1P28481 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col2a1P28481 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Col2a1P28481 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col2a1P28481 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col2a1P28481 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col2a1P28481 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col2a1P28481 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col2a1P28481 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col2a1P28481 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col2a1P28481 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col2a1P28481 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Col2a1P28481 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col2a1P28481 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col2a1P28481 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Col2a1P28481 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Col2a1P28481 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col2a1P28481 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col2a1P28481 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Col2a1P28481 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Col2a1P28481 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Col2a1P28481 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Col2a1P28481 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Col2a1P28481 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Col2a1P28481 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Col2a1P28481 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Col2a1P28481 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Col2a1P28481 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col2a1P28481 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col2a1P28481 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Col2a1P28481 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col2a1P28481 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col2a1P28481 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Col2a1P28481 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col2a1P28481 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col2a1P28481 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col2a1P28481 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Col2a1P28481 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Col2a1P28481 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Col2a1P28481 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col2a1P28481 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col2a1P28481 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col2a1P28481 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Col2a1P28481 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Col2a1P28481 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Col2a1P28481 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Col2a1P28481 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Col2a1P28481 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Col2a1P28481 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Col2a1P28481 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Col2a1P28481 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Col2a1P28481 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Col2a1P28481 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Col2a1P28481 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Col2a1P28481 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Col2a1P28481 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Col2a1P28481 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Col2a1P28481 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col2a1P28481 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Col2a1P28481 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col2a1P28481 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col2a1P28481 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col2a1P28481 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col2a1P28481 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col2a1P28481 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col2a1P28481 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Col2a1P28481 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Col2a1P28481 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms