Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gjb1P28230 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gjb1P28230 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gjb1P28230 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gjb1P28230 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gjb1P28230 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gjb1P28230 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gjb1P28230 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gjb1P28230 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gjb1P28230 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gjb1P28230 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Gjb1P28230 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gjb1P28230 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gjb1P28230 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gjb1P28230 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gjb1P28230 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gjb1P28230 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gjb1P28230 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gjb1P28230 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Gjb1P28230 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gjb1P28230 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gjb1P28230 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gjb1P28230 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gjb1P28230 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gjb1P28230 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gjb1P28230 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gjb1P28230 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gjb1P28230 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gjb1P28230 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gjb1P28230 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gjb1P28230 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gjb1P28230 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gjb1P28230 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gjb1P28230 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gjb1P28230 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gjb1P28230 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gjb1P28230 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gjb1P28230 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gjb1P28230 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gjb1P28230 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gjb1P28230 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb1P28230 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb1P28230 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gjb1P28230 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Gjb1P28230 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gjb1P28230 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Gjb1P28230 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gjb1P28230 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gjb1P28230 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gjb1P28230 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gjb1P28230 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gjb1P28230 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Gjb1P28230 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Gjb1P28230 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gjb1P28230 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb1P28230 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb1P28230 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Gjb1P28230 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gjb1P28230 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Gjb1P28230 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gjb1P28230 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gjb1P28230 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gjb1P28230 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gjb1P28230 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gjb1P28230 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gjb1P28230 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gjb1P28230 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gjb1P28230 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gjb1P28230 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Gjb1P28230 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gjb1P28230 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gjb1P28230 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gjb1P28230 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb1P28230 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb1P28230 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb1P28230 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb1P28230 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb1P28230 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjb1P28230 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gjb1P28230 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gjb1P28230 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjb1P28230 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gjb1P28230 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb1P28230 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gjb1P28230 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb1P28230 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms