Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CenpbP27790 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CenpbP27790 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CenpbP27790 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CenpbP27790 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CenpbP27790 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CenpbP27790 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CenpbP27790 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CenpbP27790 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CenpbP27790 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CenpbP27790 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CenpbP27790 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CenpbP27790 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CenpbP27790 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CenpbP27790 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CenpbP27790 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CenpbP27790 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CenpbP27790 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CenpbP27790 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CenpbP27790 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CenpbP27790 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CenpbP27790 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CenpbP27790 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CenpbP27790 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CenpbP27790 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CenpbP27790 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CenpbP27790 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CenpbP27790 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CenpbP27790 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CenpbP27790 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CenpbP27790 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CenpbP27790 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CenpbP27790 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CenpbP27790 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CenpbP27790 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CenpbP27790 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CenpbP27790 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CenpbP27790 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CenpbP27790 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CenpbP27790 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CenpbP27790 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CenpbP27790 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CenpbP27790 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CenpbP27790 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CenpbP27790 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CenpbP27790 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CenpbP27790 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CenpbP27790 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CenpbP27790 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CenpbP27790 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CenpbP27790 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CenpbP27790 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CenpbP27790 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CenpbP27790 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CenpbP27790 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms