Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx3P23198 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx3P23198 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx3P23198 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx3P23198 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx3P23198 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx3P23198 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx3P23198 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx3P23198 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx3P23198 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx3P23198 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx3P23198 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx3P23198 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx3P23198 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx3P23198 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx3P23198 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx3P23198 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx3P23198 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx3P23198 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx3P23198 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx3P23198 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx3P23198 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx3P23198 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx3P23198 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx3P23198 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx3P23198 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx3P23198 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms