Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bmp4P21275 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bmp4P21275 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bmp4P21275 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bmp4P21275 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bmp4P21275 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bmp4P21275 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bmp4P21275 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bmp4P21275 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bmp4P21275 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bmp4P21275 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bmp4P21275 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bmp4P21275 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bmp4P21275 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Bmp4P21275 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bmp4P21275 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bmp4P21275 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bmp4P21275 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bmp4P21275 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bmp4P21275 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bmp4P21275 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bmp4P21275 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bmp4P21275 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bmp4P21275 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bmp4P21275 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bmp4P21275 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Bmp4P21275 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bmp4P21275 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bmp4P21275 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bmp4P21275 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bmp4P21275 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bmp4P21275 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bmp4P21275 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bmp4P21275 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bmp4P21275 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bmp4P21275 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bmp4P21275 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bmp4P21275 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bmp4P21275 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bmp4P21275 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Bmp4P21275 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bmp4P21275 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bmp4P21275 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bmp4P21275 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.2 ms