Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama1P19137 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Lama1P19137 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama1P19137 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama1P19137 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lama1P19137 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama1P19137 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama1P19137 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama1P19137 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama1P19137 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lama1P19137 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama1P19137 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama1P19137 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama1P19137 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama1P19137 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama1P19137 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama1P19137 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama1P19137 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama1P19137 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama1P19137 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama1P19137 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama1P19137 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama1P19137 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lama1P19137 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama1P19137 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lama1P19137 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lama1P19137 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama1P19137 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama1P19137 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama1P19137 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama1P19137 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama1P19137 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama1P19137 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama1P19137 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama1P19137 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama1P19137 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama1P19137 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama1P19137 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lama1P19137 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama1P19137 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama1P19137 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lama1P19137 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lama1P19137 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama1P19137 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama1P19137 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lama1P19137 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lama1P19137 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama1P19137 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama1P19137 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama1P19137 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lama1P19137 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama1P19137 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama1P19137 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lama1P19137 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lama1P19137 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lama1P19137 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama1P19137 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lama1P19137 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama1P19137 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama1P19137 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama1P19137 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama1P19137 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama1P19137 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama1P19137 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama1P19137 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama1P19137 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama1P19137 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama1P19137 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Lama1P19137 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama1P19137 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama1P19137 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama1P19137 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama1P19137 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama1P19137 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama1P19137 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama1P19137 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama1P19137 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama1P19137 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama1P19137 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama1P19137 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms