Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RargP18911 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RargP18911 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RargP18911 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RargP18911 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RargP18911 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RargP18911 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RargP18911 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RargP18911 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RargP18911 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RargP18911 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RargP18911 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RargP18911 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RargP18911 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RargP18911 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RargP18911 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RargP18911 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RargP18911 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RargP18911 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RargP18911 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RargP18911 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RargP18911 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RargP18911 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RargP18911 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RargP18911 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RargP18911 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RargP18911 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RargP18911 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RargP18911 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RargP18911 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RargP18911 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RargP18911 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RargP18911 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RargP18911 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RargP18911 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RargP18911 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RargP18911 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RargP18911 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RargP18911 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RargP18911 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RargP18911 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RargP18911 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RargP18911 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RargP18911 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RargP18911 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RargP18911 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RargP18911 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RargP18911 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RargP18911 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RargP18911 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RargP18911 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RargP18911 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RargP18911 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RargP18911 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RargP18911 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RargP18911 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RargP18911 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RargP18911 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RargP18911 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RargP18911 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RargP18911 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RargP18911 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RargP18911 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RargP18911 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RargP18911 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RargP18911 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RargP18911 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RargP18911 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RargP18911 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RargP18911 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RargP18911 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RargP18911 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RargP18911 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RargP18911 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RargP18911 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RargP18911 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RargP18911 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RargP18911 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RargP18911 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RargP18911 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RargP18911 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RargP18911 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RargP18911 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RargP18911 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RargP18911 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RargP18911 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RargP18911 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RargP18911 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RargP18911 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RargP18911 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RargP18911 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RargP18911 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RargP18911 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RargP18911 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RargP18911 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RargP18911 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RargP18911 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RargP18911 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RargP18911 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RargP18911 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms