Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RpsaP14206 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RpsaP14206 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RpsaP14206 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RpsaP14206 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RpsaP14206 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RpsaP14206 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RpsaP14206 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RpsaP14206 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RpsaP14206 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RpsaP14206 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RpsaP14206 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RpsaP14206 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RpsaP14206 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RpsaP14206 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RpsaP14206 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RpsaP14206 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RpsaP14206 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RpsaP14206 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RpsaP14206 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RpsaP14206 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RpsaP14206 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RpsaP14206 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RpsaP14206 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RpsaP14206 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RpsaP14206 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RpsaP14206 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RpsaP14206 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RpsaP14206 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RpsaP14206 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RpsaP14206 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RpsaP14206 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RpsaP14206 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RpsaP14206 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RpsaP14206 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RpsaP14206 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RpsaP14206 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RpsaP14206 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RpsaP14206 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RpsaP14206 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RpsaP14206 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms