Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctla2aP12399 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctla2aP12399 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctla2aP12399 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctla2aP12399 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctla2aP12399 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctla2aP12399 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctla2aP12399 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctla2aP12399 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctla2aP12399 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctla2aP12399 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctla2aP12399 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctla2aP12399 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctla2aP12399 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctla2aP12399 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctla2aP12399 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctla2aP12399 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctla2aP12399 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctla2aP12399 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctla2aP12399 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctla2aP12399 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctla2aP12399 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctla2aP12399 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctla2aP12399 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2aP12399 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2aP12399 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctla2aP12399 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2aP12399 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctla2aP12399 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctla2aP12399 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2aP12399 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctla2aP12399 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2aP12399 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctla2aP12399 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctla2aP12399 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms