Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hoxc6P10629 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxc6P10629 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxc6P10629 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hoxc6P10629 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxc6P10629 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxc6P10629 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxc6P10629 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxc6P10629 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxc6P10629 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxc6P10629 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxc6P10629 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hoxc6P10629 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Hoxc6P10629 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxc6P10629 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hoxc6P10629 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hoxc6P10629 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxc6P10629 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hoxc6P10629 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxc6P10629 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxc6P10629 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxc6P10629 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxc6P10629 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxc6P10629 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Hoxc6P10629 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hoxc6P10629 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hoxc6P10629 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hoxc6P10629 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hoxc6P10629 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hoxc6P10629 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hoxc6P10629 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxc6P10629 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxc6P10629 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Hoxc6P10629 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxc6P10629 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc6P10629 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc6P10629 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc6P10629 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc6P10629 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxc6P10629 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc6P10629 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxc6P10629 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxc6P10629 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxc6P10629 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc6P10629 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc6P10629 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hoxc6P10629 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hoxc6P10629 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxc6P10629 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxc6P10629 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc6P10629 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc6P10629 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxc6P10629 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxc6P10629 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxc6P10629 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc6P10629 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc6P10629 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxc6P10629 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxc6P10629 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc6P10629 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2353.1 ms