Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4P10628 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd4P10628 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd4P10628 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd4P10628 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd4P10628 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd4P10628 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd4P10628 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd4P10628 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd4P10628 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd4P10628 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd4P10628 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd4P10628 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd4P10628 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd4P10628 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd4P10628 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd4P10628 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd4P10628 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd4P10628 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd4P10628 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd4P10628 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd4P10628 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd4P10628 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd4P10628 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd4P10628 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd4P10628 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd4P10628 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd4P10628 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd4P10628 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd4P10628 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd4P10628 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd4P10628 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxd4P10628 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxd4P10628 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd4P10628 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms