Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh3P10287 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh3P10287 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh3P10287 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh3P10287 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh3P10287 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh3P10287 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh3P10287 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh3P10287 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh3P10287 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh3P10287 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh3P10287 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh3P10287 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh3P10287 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh3P10287 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh3P10287 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh3P10287 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh3P10287 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh3P10287 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh3P10287 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh3P10287 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh3P10287 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh3P10287 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh3P10287 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh3P10287 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms