Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb8P09632 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb8P09632 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxb8P09632 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb8P09632 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxb8P09632 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxb8P09632 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxb8P09632 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxb8P09632 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxb8P09632 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxb8P09632 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxb8P09632 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxb8P09632 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxb8P09632 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxb8P09632 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxb8P09632 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxb8P09632 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxb8P09632 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxb8P09632 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxb8P09632 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxb8P09632 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxb8P09632 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hoxb8P09632 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxb8P09632 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxb8P09632 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxb8P09632 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxb8P09632 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxb8P09632 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxb8P09632 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxb8P09632 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxb8P09632 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hoxb8P09632 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxb8P09632 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxb8P09632 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxb8P09632 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxb8P09632 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxb8P09632 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxb8P09632 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb8P09632 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxb8P09632 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxb8P09632 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb8P09632 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb8P09632 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb8P09632 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb8P09632 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb8P09632 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms