Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Hoxb7P09024 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Hoxb7P09024 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Hoxb7P09024 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Hoxb7P09024 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hoxb7P09024 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hoxb7P09024 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Hoxb7P09024 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Hoxb7P09024 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Hoxb7P09024 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Hoxb7P09024 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Hoxb7P09024 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Hoxb7P09024 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Hoxb7P09024 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hoxb7P09024 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hoxb7P09024 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Hoxb7P09024 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Hoxb7P09024 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Hoxb7P09024 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Hoxb7P09024 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Hoxb7P09024 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hoxb7P09024 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hoxb7P09024 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hoxb7P09024 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hoxb7P09024 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Hoxb7P09024 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Hoxb7P09024 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hoxb7P09024 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hoxb7P09024 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hoxb7P09024 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hoxb7P09024 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Hoxb7P09024 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Hoxb7P09024 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Hoxb7P09024 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Hoxb7P09024 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Hoxb7P09024 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Hoxb7P09024 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Hoxb7P09024 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Hoxb7P09024 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hoxb7P09024 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Hoxb7P09024 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Hoxb7P09024 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Hoxb7P09024 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Hoxb7P09024 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Hoxb7P09024 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Hoxb7P09024 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Hoxb7P09024 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Hoxb7P09024 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Hoxb7P09024 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Hoxb7P09024 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Hoxb7P09024 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Hoxb7P09024 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Hoxb7P09024 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Hoxb7P09024 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Hoxb7P09024 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Hoxb7P09024 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Hoxb7P09024 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Hoxb7P09024 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Hoxb7P09024 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Hoxb7P09024 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Hoxb7P09024 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Hoxb7P09024 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Hoxb7P09024 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Hoxb7P09024 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Hoxb7P09024 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Hoxb7P09024 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Hoxb7P09024 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Hoxb7P09024 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Hoxb7P09024 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Hoxb7P09024 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hoxb7P09024 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Hoxb7P09024 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hoxb7P09024 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms