Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CrygdP04342 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CrygdP04342 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CrygdP04342 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CrygdP04342 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CrygdP04342 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CrygdP04342 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrygdP04342 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrygdP04342 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrygdP04342 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrygdP04342 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrygdP04342 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrygdP04342 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrygdP04342 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrygdP04342 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CrygdP04342 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrygdP04342 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrygdP04342 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrygdP04342 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CrygdP04342 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CrygdP04342 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CrygdP04342 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CrygdP04342 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CrygdP04342 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CrygdP04342 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CrygdP04342 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CrygdP04342 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CrygdP04342 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CrygdP04342 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CrygdP04342 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrygdP04342 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrygdP04342 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrygdP04342 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrygdP04342 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrygdP04342 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CrygdP04342 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrygdP04342 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrygdP04342 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrygdP04342 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrygdP04342 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrygdP04342 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrygdP04342 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrygdP04342 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms