Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01837 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01837 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01837 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01837 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01837 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01837 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01837 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01837 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01837 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01837 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01837 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01837 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01837 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01837 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01837 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01837 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01837 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01837 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01837 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01837 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01837 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01837 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01837 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01837 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01837 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01837 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01837 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01837 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01837 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01837 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01837 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01837 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01837 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01837 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01837 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01837 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01837 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01837 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01837 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01837 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01837 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01837 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01837 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01837 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01837 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01837 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01837 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01837 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01837 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01837 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01837 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01837 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01837 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01837 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01837 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01837 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01837 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01837 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01837 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01837 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01837 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01837 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01837 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01837 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01837 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01837 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01837 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01837 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01837 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01837 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01837 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01837 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01837 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01837 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01837 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01837 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01837 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01837 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01837 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01837 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01837 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01837 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01837 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01837 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01837 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01837 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01837 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01837 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01837 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01837 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01837 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01837 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01837 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01837 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01837 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01837 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01837 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
P01837 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01837 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms