Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FiglaO55208 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FiglaO55208 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FiglaO55208 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FiglaO55208 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FiglaO55208 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FiglaO55208 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FiglaO55208 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FiglaO55208 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FiglaO55208 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FiglaO55208 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FiglaO55208 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FiglaO55208 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FiglaO55208 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FiglaO55208 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FiglaO55208 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FiglaO55208 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FiglaO55208 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FiglaO55208 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FiglaO55208 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FiglaO55208 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FiglaO55208 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FiglaO55208 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FiglaO55208 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FiglaO55208 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FiglaO55208 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FiglaO55208 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FiglaO55208 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FiglaO55208 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FiglaO55208 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FiglaO55208 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FiglaO55208 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FiglaO55208 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FiglaO55208 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FiglaO55208 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FiglaO55208 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FiglaO55208 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FiglaO55208 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FiglaO55208 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FiglaO55208 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms