Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1bO55017 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacna1bO55017 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cacna1bO55017 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cacna1bO55017 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cacna1bO55017 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1bO55017 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1bO55017 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1bO55017 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cacna1bO55017 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1bO55017 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1bO55017 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1bO55017 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1bO55017 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1bO55017 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna1bO55017 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1bO55017 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1bO55017 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1bO55017 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1bO55017 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1bO55017 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1bO55017 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1bO55017 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1bO55017 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1bO55017 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1bO55017 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1bO55017 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1bO55017 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1bO55017 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1bO55017 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1bO55017 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1bO55017 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1bO55017 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1bO55017 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1bO55017 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1bO55017 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1bO55017 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1bO55017 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1bO55017 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1bO55017 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1bO55017 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1bO55017 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1bO55017 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1bO55017 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1bO55017 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1bO55017 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1bO55017 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1bO55017 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1bO55017 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1bO55017 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1bO55017 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1bO55017 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1bO55017 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1bO55017 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1bO55017 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1bO55017 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1bO55017 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1bO55017 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1bO55017 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1bO55017 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1bO55017 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1bO55017 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1bO55017 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1bO55017 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1bO55017 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1bO55017 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms