Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Cacna1bO55017 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Cacna1bO55017 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Cacna1bO55017 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Cacna1bO55017 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Cacna1bO55017 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Cacna1bO55017 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Cacna1bO55017 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Cacna1bO55017 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Cacna1bO55017 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Cacna1bO55017 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Cacna1bO55017 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Cacna1bO55017 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Cacna1bO55017 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Cacna1bO55017 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Cacna1bO55017 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cacna1bO55017 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Cacna1bO55017 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cacna1bO55017 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cacna1bO55017 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Cacna1bO55017 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cacna1bO55017 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Cacna1bO55017 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cacna1bO55017 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cacna1bO55017 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cacna1bO55017 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Cacna1bO55017 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cacna1bO55017 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cacna1bO55017 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Cacna1bO55017 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cacna1bO55017 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cacna1bO55017 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cacna1bO55017 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Cacna1bO55017 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Cacna1bO55017 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cacna1bO55017 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Cacna1bO55017 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Cacna1bO55017 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Cacna1bO55017 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Cacna1bO55017 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Cacna1bO55017 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Cacna1bO55017 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Cacna1bO55017 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Cacna1bO55017 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Cacna1bO55017 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Cacna1bO55017 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Cacna1bO55017 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Cacna1bO55017 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Cacna1bO55017 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Cacna1bO55017 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cacna1bO55017 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cacna1bO55017 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cacna1bO55017 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cacna1bO55017 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cacna1bO55017 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Cacna1bO55017 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cacna1bO55017 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cacna1bO55017 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cacna1bO55017 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cacna1bO55017 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cacna1bO55017 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cacna1bO55017 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cacna1bO55017 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cacna1bO55017 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Cacna1bO55017 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Cacna1bO55017 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45,7 ms