Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnk2O54967 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnk2O54967 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnk2O54967 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnk2O54967 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnk2O54967 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnk2O54967 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnk2O54967 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnk2O54967 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tnk2O54967 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnk2O54967 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnk2O54967 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnk2O54967 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnk2O54967 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnk2O54967 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnk2O54967 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnk2O54967 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnk2O54967 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnk2O54967 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnk2O54967 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnk2O54967 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnk2O54967 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnk2O54967 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnk2O54967 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnk2O54967 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnk2O54967 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnk2O54967 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tnk2O54967 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnk2O54967 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnk2O54967 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnk2O54967 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnk2O54967 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnk2O54967 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnk2O54967 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnk2O54967 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnk2O54967 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnk2O54967 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnk2O54967 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnk2O54967 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnk2O54967 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnk2O54967 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnk2O54967 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnk2O54967 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnk2O54967 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnk2O54967 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnk2O54967 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnk2O54967 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnk2O54967 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnk2O54967 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnk2O54967 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnk2O54967 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnk2O54967 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms