Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EdaO54693 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EdaO54693 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EdaO54693 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EdaO54693 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EdaO54693 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EdaO54693 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EdaO54693 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EdaO54693 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EdaO54693 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EdaO54693 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EdaO54693 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EdaO54693 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EdaO54693 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EdaO54693 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EdaO54693 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EdaO54693 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EdaO54693 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EdaO54693 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EdaO54693 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EdaO54693 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EdaO54693 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EdaO54693 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EdaO54693 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EdaO54693 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EdaO54693 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EdaO54693 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EdaO54693 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EdaO54693 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EdaO54693 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EdaO54693 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EdaO54693 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EdaO54693 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EdaO54693 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EdaO54693 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EdaO54693 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EdaO54693 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EdaO54693 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EdaO54693 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EdaO54693 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EdaO54693 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EdaO54693 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EdaO54693 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EdaO54693 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EdaO54693 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EdaO54693 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EdaO54693 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EdaO54693 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EdaO54693 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EdaO54693 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EdaO54693 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EdaO54693 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EdaO54693 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EdaO54693 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EdaO54693 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EdaO54693 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EdaO54693 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EdaO54693 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EdaO54693 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EdaO54693 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EdaO54693 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EdaO54693 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EdaO54693 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EdaO54693 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EdaO54693 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EdaO54693 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EdaO54693 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EdaO54693 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EdaO54693 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EdaO54693 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EdaO54693 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EdaO54693 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EdaO54693 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EdaO54693 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EdaO54693 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EdaO54693 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EdaO54693 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EdaO54693 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EdaO54693 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EdaO54693 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EdaO54693 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EdaO54693 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EdaO54693 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EdaO54693 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EdaO54693 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EdaO54693 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EdaO54693 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EdaO54693 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EdaO54693 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EdaO54693 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EdaO54693 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EdaO54693 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EdaO54693 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EdaO54693 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EdaO54693 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EdaO54693 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EdaO54693 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EdaO54693 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EdaO54693 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EdaO54693 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms