Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ppfibp2O35711 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ppfibp2O35711 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ppfibp2O35711 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ppfibp2O35711 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ppfibp2O35711 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ppfibp2O35711 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ppfibp2O35711 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Ppfibp2O35711 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ppfibp2O35711 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ppfibp2O35711 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppfibp2O35711 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppfibp2O35711 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppfibp2O35711 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ppfibp2O35711 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ppfibp2O35711 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Ppfibp2O35711 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ppfibp2O35711 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ppfibp2O35711 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ppfibp2O35711 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ppfibp2O35711 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ppfibp2O35711 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ppfibp2O35711 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ppfibp2O35711 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ppfibp2O35711 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ppfibp2O35711 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ppfibp2O35711 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ppfibp2O35711 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ppfibp2O35711 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ppfibp2O35711 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ppfibp2O35711 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ppfibp2O35711 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Ppfibp2O35711 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ppfibp2O35711 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ppfibp2O35711 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ppfibp2O35711 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ppfibp2O35711 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ppfibp2O35711 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ppfibp2O35711 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ppfibp2O35711 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ppfibp2O35711 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ppfibp2O35711 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ppfibp2O35711 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ppfibp2O35711 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ppfibp2O35711 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ppfibp2O35711 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ppfibp2O35711 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ppfibp2O35711 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ppfibp2O35711 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ppfibp2O35711 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ppfibp2O35711 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ppfibp2O35711 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ppfibp2O35711 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Ppfibp2O35711 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ppfibp2O35711 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ppfibp2O35711 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ppfibp2O35711 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ppfibp2O35711 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ppfibp2O35711 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ppfibp2O35711 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Ppfibp2O35711 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppfibp2O35711 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppfibp2O35711 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppfibp2O35711 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ppfibp2O35711 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ppfibp2O35711 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Ppfibp2O35711 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ppfibp2O35711 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ppfibp2O35711 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ppfibp2O35711 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ppfibp2O35711 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ppfibp2O35711 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ppfibp2O35711 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ppfibp2O35711 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ppfibp2O35711 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ppfibp2O35711 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ppfibp2O35711 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ppfibp2O35711 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ppfibp2O35711 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ppfibp2O35711 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ppfibp2O35711 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ppfibp2O35711 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ppfibp2O35711 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ppfibp2O35711 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ppfibp2O35711 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ppfibp2O35711 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms