Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Opn1mwO35599 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Opn1mwO35599 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Opn1mwO35599 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Opn1mwO35599 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Opn1mwO35599 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Opn1mwO35599 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Opn1mwO35599 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Opn1mwO35599 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Opn1mwO35599 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Opn1mwO35599 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Opn1mwO35599 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Opn1mwO35599 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Opn1mwO35599 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Opn1mwO35599 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Opn1mwO35599 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Opn1mwO35599 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Opn1mwO35599 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Opn1mwO35599 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Opn1mwO35599 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Opn1mwO35599 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Opn1mwO35599 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Opn1mwO35599 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Opn1mwO35599 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Opn1mwO35599 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Opn1mwO35599 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Opn1mwO35599 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Opn1mwO35599 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Opn1mwO35599 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Opn1mwO35599 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Opn1mwO35599 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Opn1mwO35599 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Opn1mwO35599 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Opn1mwO35599 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Opn1mwO35599 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Opn1mwO35599 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Opn1mwO35599 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Opn1mwO35599 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Opn1mwO35599 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Opn1mwO35599 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Opn1mwO35599 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Opn1mwO35599 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Opn1mwO35599 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Opn1mwO35599 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Opn1mwO35599 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Opn1mwO35599 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Opn1mwO35599 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Opn1mwO35599 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Opn1mwO35599 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Opn1mwO35599 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Opn1mwO35599 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Opn1mwO35599 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Opn1mwO35599 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Opn1mwO35599 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Opn1mwO35599 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Opn1mwO35599 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Opn1mwO35599 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Opn1mwO35599 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms