Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad7O35253 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad7O35253 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad7O35253 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad7O35253 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad7O35253 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad7O35253 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad7O35253 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad7O35253 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad7O35253 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad7O35253 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad7O35253 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad7O35253 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad7O35253 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad7O35253 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad7O35253 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad7O35253 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad7O35253 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad7O35253 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad7O35253 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad7O35253 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad7O35253 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad7O35253 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad7O35253 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad7O35253 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad7O35253 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad7O35253 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad7O35253 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad7O35253 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad7O35253 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad7O35253 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smad7O35253 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad7O35253 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad7O35253 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad7O35253 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad7O35253 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad7O35253 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad7O35253 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad7O35253 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad7O35253 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad7O35253 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Smad7O35253 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad7O35253 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad7O35253 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad7O35253 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad7O35253 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad7O35253 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad7O35253 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad7O35253 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad7O35253 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad7O35253 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad7O35253 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad7O35253 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad7O35253 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smad7O35253 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad7O35253 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad7O35253 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad7O35253 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad7O35253 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad7O35253 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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