Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nedd9O35177 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nedd9O35177 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nedd9O35177 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nedd9O35177 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nedd9O35177 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nedd9O35177 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nedd9O35177 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nedd9O35177 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nedd9O35177 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Nedd9O35177 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nedd9O35177 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nedd9O35177 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nedd9O35177 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nedd9O35177 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nedd9O35177 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nedd9O35177 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nedd9O35177 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nedd9O35177 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nedd9O35177 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nedd9O35177 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd9O35177 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd9O35177 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd9O35177 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd9O35177 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nedd9O35177 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nedd9O35177 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nedd9O35177 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nedd9O35177 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nedd9O35177 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nedd9O35177 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd9O35177 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd9O35177 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nedd9O35177 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nedd9O35177 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nedd9O35177 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nedd9O35177 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nedd9O35177 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nedd9O35177 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nedd9O35177 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nedd9O35177 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nedd9O35177 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nedd9O35177 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nedd9O35177 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd9O35177 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nedd9O35177 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nedd9O35177 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nedd9O35177 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd9O35177 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd9O35177 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nedd9O35177 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nedd9O35177 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nedd9O35177 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nedd9O35177 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nedd9O35177 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nedd9O35177 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nedd9O35177 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nedd9O35177 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nedd9O35177 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nedd9O35177 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd9O35177 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd9O35177 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nedd9O35177 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nedd9O35177 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nedd9O35177 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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