Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK6

Aldh3b3, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b3J3QMK6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Aldh3b3J3QMK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh3b3J3QMK6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3b3J3QMK6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b3J3QMK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3b3J3QMK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3b3J3QMK6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3b3J3QMK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3b3J3QMK6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3b3J3QMK6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh3b3J3QMK6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3b3J3QMK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh3b3J3QMK6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh3b3J3QMK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh3b3J3QMK6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aldh3b3J3QMK6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aldh3b3J3QMK6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms