Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r167G3UW71 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r167G3UW71 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r167G3UW71 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r167G3UW71 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r167G3UW71 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn1r167G3UW71 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r167G3UW71 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r167G3UW71 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r167G3UW71 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r167G3UW71 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r167G3UW71 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r167G3UW71 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r167G3UW71 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r167G3UW71 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r167G3UW71 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r167G3UW71 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r167G3UW71 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r167G3UW71 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r167G3UW71 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r167G3UW71 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r167G3UW71 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r167G3UW71 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r167G3UW71 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r167G3UW71 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r167G3UW71 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r167G3UW71 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r167G3UW71 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r167G3UW71 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r167G3UW71 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r167G3UW71 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r167G3UW71 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r167G3UW71 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r167G3UW71 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r167G3UW71 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r167G3UW71 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r167G3UW71 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r167G3UW71 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r167G3UW71 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r167G3UW71 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r167G3UW71 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r167G3UW71 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r167G3UW71 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r167G3UW71 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r167G3UW71 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r167G3UW71 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms