Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa27F2Z403 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa27F2Z403 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa27F2Z403 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa27F2Z403 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa27F2Z403 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa27F2Z403 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa27F2Z403 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa27F2Z403 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa27F2Z403 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa27F2Z403 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms