Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp3E9Q1T6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp3E9Q1T6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp3E9Q1T6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp3E9Q1T6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp3E9Q1T6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp3E9Q1T6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp3E9Q1T6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp3E9Q1T6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp3E9Q1T6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp3E9Q1T6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp3E9Q1T6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp3E9Q1T6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp3E9Q1T6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp3E9Q1T6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp3E9Q1T6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp3E9Q1T6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp3E9Q1T6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp3E9Q1T6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp3E9Q1T6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp3E9Q1T6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrp3E9Q1T6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrp3E9Q1T6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrp3E9Q1T6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrp3E9Q1T6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp3E9Q1T6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp3E9Q1T6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrp3E9Q1T6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp3E9Q1T6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp3E9Q1T6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrp3E9Q1T6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp3E9Q1T6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp3E9Q1T6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrp3E9Q1T6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrp3E9Q1T6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrp3E9Q1T6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp3E9Q1T6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp3E9Q1T6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp3E9Q1T6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrp3E9Q1T6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrp3E9Q1T6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrp3E9Q1T6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp3E9Q1T6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrp3E9Q1T6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrp3E9Q1T6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrp3E9Q1T6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrp3E9Q1T6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrp3E9Q1T6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrp3E9Q1T6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrp3E9Q1T6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrp3E9Q1T6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrp3E9Q1T6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrp3E9Q1T6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
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