Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0A8

Krtap20-2, Keratin-associated protein 20-2, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap20-2E9Q0A8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Krtap20-2E9Q0A8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap20-2E9Q0A8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap20-2E9Q0A8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap20-2E9Q0A8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap20-2E9Q0A8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap20-2E9Q0A8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap20-2E9Q0A8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap20-2E9Q0A8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Krtap20-2E9Q0A8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap20-2E9Q0A8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Krtap20-2E9Q0A8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Krtap20-2E9Q0A8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap20-2E9Q0A8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Krtap20-2E9Q0A8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms