Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Galntl6E5D8G1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Galntl6E5D8G1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Galntl6E5D8G1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Galntl6E5D8G1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Galntl6E5D8G1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Galntl6E5D8G1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Galntl6E5D8G1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Galntl6E5D8G1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Galntl6E5D8G1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Galntl6E5D8G1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Galntl6E5D8G1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Galntl6E5D8G1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Galntl6E5D8G1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Galntl6E5D8G1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Galntl6E5D8G1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Galntl6E5D8G1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Galntl6E5D8G1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Galntl6E5D8G1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Galntl6E5D8G1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Galntl6E5D8G1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Galntl6E5D8G1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Galntl6E5D8G1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Galntl6E5D8G1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Galntl6E5D8G1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Galntl6E5D8G1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Galntl6E5D8G1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Galntl6E5D8G1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Galntl6E5D8G1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Galntl6E5D8G1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Galntl6E5D8G1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Galntl6E5D8G1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms