Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnb1ip1D3Z3K2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms