Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3676D3Z236 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3676D3Z236 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3676D3Z236 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3676D3Z236 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3676D3Z236 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3676D3Z236 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3676D3Z236 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3676D3Z236 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3676D3Z236 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3676D3Z236 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3676D3Z236 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3676D3Z236 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3676D3Z236 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3676D3Z236 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3676D3Z236 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3676D3Z236 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3676D3Z236 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3676D3Z236 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3676D3Z236 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3676D3Z236 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3676D3Z236 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3676D3Z236 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3676D3Z236 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3676D3Z236 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3676D3Z236 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3676D3Z236 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3676D3Z236 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3676D3Z236 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3676D3Z236 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3676D3Z236 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3676D3Z236 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3676D3Z236 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3676D3Z236 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3676D3Z236 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225 ms