Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd8B9EJ80 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd8B9EJ80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd8B9EJ80 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd8B9EJ80 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd8B9EJ80 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd8B9EJ80 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd8B9EJ80 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd8B9EJ80 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd8B9EJ80 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd8B9EJ80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd8B9EJ80 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd8B9EJ80 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd8B9EJ80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd8B9EJ80 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzd8B9EJ80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzd8B9EJ80 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd8B9EJ80 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd8B9EJ80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd8B9EJ80 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd8B9EJ80 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd8B9EJ80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd8B9EJ80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd8B9EJ80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd8B9EJ80 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd8B9EJ80 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd8B9EJ80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd8B9EJ80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd8B9EJ80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd8B9EJ80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd8B9EJ80 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd8B9EJ80 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd8B9EJ80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd8B9EJ80 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd8B9EJ80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzd8B9EJ80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd8B9EJ80 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd8B9EJ80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd8B9EJ80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdzd8B9EJ80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdzd8B9EJ80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd8B9EJ80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd8B9EJ80 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdzd8B9EJ80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd8B9EJ80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms