Protein–RNA interactions for Protein: A2BHN9

4931422A03Rik, RIKEN cDNA 4931422A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931422A03RikA2BHN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931422A03RikA2BHN9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931422A03RikA2BHN9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931422A03RikA2BHN9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931422A03RikA2BHN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931422A03RikA2BHN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931422A03RikA2BHN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931422A03RikA2BHN9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931422A03RikA2BHN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931422A03RikA2BHN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931422A03RikA2BHN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931422A03RikA2BHN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931422A03RikA2BHN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931422A03RikA2BHN9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931422A03RikA2BHN9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931422A03RikA2BHN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931422A03RikA2BHN9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931422A03RikA2BHN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931422A03RikA2BHN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931422A03RikA2BHN9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931422A03RikA2BHN9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931422A03RikA2BHN9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931422A03RikA2BHN9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931422A03RikA2BHN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931422A03RikA2BHN9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4931422A03RikA2BHN9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4931422A03RikA2BHN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931422A03RikA2BHN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931422A03RikA2BHN9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4931422A03RikA2BHN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms