Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Szt2A2A9C3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Szt2A2A9C3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Szt2A2A9C3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Szt2A2A9C3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Szt2A2A9C3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Szt2A2A9C3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Szt2A2A9C3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Szt2A2A9C3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Szt2A2A9C3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Szt2A2A9C3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Szt2A2A9C3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Szt2A2A9C3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Szt2A2A9C3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Szt2A2A9C3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Szt2A2A9C3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Szt2A2A9C3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Szt2A2A9C3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Szt2A2A9C3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Szt2A2A9C3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Szt2A2A9C3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Szt2A2A9C3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Szt2A2A9C3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Szt2A2A9C3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Szt2A2A9C3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Szt2A2A9C3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Szt2A2A9C3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Szt2A2A9C3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Szt2A2A9C3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Szt2A2A9C3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Szt2A2A9C3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Szt2A2A9C3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Szt2A2A9C3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Szt2A2A9C3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Szt2A2A9C3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Szt2A2A9C3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Szt2A2A9C3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Szt2A2A9C3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Szt2A2A9C3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Szt2A2A9C3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Szt2A2A9C3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Szt2A2A9C3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Szt2A2A9C3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Szt2A2A9C3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Szt2A2A9C3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Szt2A2A9C3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Szt2A2A9C3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Szt2A2A9C3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Szt2A2A9C3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Szt2A2A9C3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Szt2A2A9C3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Szt2A2A9C3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Szt2A2A9C3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Szt2A2A9C3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Szt2A2A9C3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Szt2A2A9C3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Szt2A2A9C3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Szt2A2A9C3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Szt2A2A9C3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Szt2A2A9C3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Szt2A2A9C3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Szt2A2A9C3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Szt2A2A9C3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Szt2A2A9C3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Szt2A2A9C3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Szt2A2A9C3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Szt2A2A9C3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Szt2A2A9C3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Szt2A2A9C3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Szt2A2A9C3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Szt2A2A9C3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Szt2A2A9C3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms