Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsg1A2A825 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsg1A2A825 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsg1A2A825 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsg1A2A825 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsg1A2A825 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsg1A2A825 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsg1A2A825 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsg1A2A825 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsg1A2A825 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsg1A2A825 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsg1A2A825 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsg1A2A825 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsg1A2A825 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsg1A2A825 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsg1A2A825 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsg1A2A825 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsg1A2A825 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rsg1A2A825 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms