Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Calcoco2A2A6M5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calcoco2A2A6M5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Calcoco2A2A6M5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Calcoco2A2A6M5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Calcoco2A2A6M5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Calcoco2A2A6M5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Calcoco2A2A6M5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Calcoco2A2A6M5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Calcoco2A2A6M5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calcoco2A2A6M5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Calcoco2A2A6M5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Calcoco2A2A6M5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Calcoco2A2A6M5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Calcoco2A2A6M5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calcoco2A2A6M5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calcoco2A2A6M5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calcoco2A2A6M5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Calcoco2A2A6M5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Calcoco2A2A6M5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Calcoco2A2A6M5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Calcoco2A2A6M5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calcoco2A2A6M5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calcoco2A2A6M5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Calcoco2A2A6M5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Calcoco2A2A6M5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Calcoco2A2A6M5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Calcoco2A2A6M5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calcoco2A2A6M5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Calcoco2A2A6M5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Calcoco2A2A6M5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Calcoco2A2A6M5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Calcoco2A2A6M5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Calcoco2A2A6M5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms