Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Calcoco2A2A6M5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Calcoco2A2A6M5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Calcoco2A2A6M5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Calcoco2A2A6M5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Calcoco2A2A6M5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Calcoco2A2A6M5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Calcoco2A2A6M5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Calcoco2A2A6M5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Calcoco2A2A6M5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Calcoco2A2A6M5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Calcoco2A2A6M5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Calcoco2A2A6M5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Calcoco2A2A6M5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Calcoco2A2A6M5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Calcoco2A2A6M5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Calcoco2A2A6M5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Calcoco2A2A6M5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Calcoco2A2A6M5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Calcoco2A2A6M5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Calcoco2A2A6M5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Calcoco2A2A6M5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Calcoco2A2A6M5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Calcoco2A2A6M5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Calcoco2A2A6M5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Calcoco2A2A6M5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Calcoco2A2A6M5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Calcoco2A2A6M5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Calcoco2A2A6M5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Calcoco2A2A6M5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Calcoco2A2A6M5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Calcoco2A2A6M5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Calcoco2A2A6M5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Calcoco2A2A6M5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Calcoco2A2A6M5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Calcoco2A2A6M5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Calcoco2A2A6M5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Calcoco2A2A6M5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Calcoco2A2A6M5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms