Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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