Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp27Q8CEG8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms