Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms