Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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