Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms