Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPOP42166 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPOP42166 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms