Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAMP1Q96JM3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAMP1Q96JM3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms