Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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