Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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