Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg16l1Q8C0J2 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Atg16l1Q8C0J2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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