Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms